清大化工系暨研究所於西元一九七二年奉准成立，原名為工業化學系。一九七八年清華大學奉准成立高分子研究所，一九八０年本系、所由原名工業化學系改名為化學工程系，並且於一九八三年與高分子研究所合併。本系現有專任教授二十五人，大學部學生約二百二十人，碩士班學生約一百四十人和博士班學生約一百五十人。

　　系主任為全體教授選出，此外系內並設有研究發展、學生、總務及環保與安全衛生四個委員會，協助系主任推動系務。本系對大學部及研究所的課程做了極大的修改，將必修的學分減至最低程度，並提供各類專修學程，充分尊重每位學生的興趣及個性，培養其在各方面的專業知識，使其畢業後能順利成為各尖端科技領域的菁英。本系教授們的研究興趣，除了傳統的化工領域外，亦積極發展奈米科技、生物工程、光電科技、精密製程技術與能源暨環境科技等。

　　化工系館建於 一九九三 年，共有八層樓近四千坪建築面積，擁有最先進的教學及研究設備。因此，學生可以在良好的環境中上課、做研究、交朋友。同時因本系位於國內尖端科技之核心地帶，和工研院、新竹科學園區及其它各大公、民營公司單位，都有密切的合作關係，因此學生畢業後都有相當誘人的出路。

　　本系教授的研究成果，已獲國內外學術界肯定，且所有的教授都獲得國科會的研究獎助。 並有多人次獲得國科會邀請研究獎；行政院國家發明獎、傑出科技獎；教育部國家講座、學術獎、大專校院教師與產業界合作研發績效卓著獎勵；中山學術文化基金會學術著作獎；傑出人才發展基金會傑出人才講座；侯金堆先生文教基金會侯金堆傑出榮譽獎；中國化工學會金開英獎等重要榮譽；本系亦先後獲天下及遠見雜誌評為化學工程系第一名。